寄生于阴湿、腐朽的树干上，生长于栎、杨、榕、槐等120多种阔叶树的腐木上；勃勃生机的银杏树上也可生长。人工培植以椴木的和袋料的为主，人工培植以椴木和袋为基体，潮湿地带生长比较多。
中国是木耳的主要生产国，产区主要分布在吉林、黑龙江、辽宁、内蒙古、广西、云南、贵州、四川、湖北、陕西和浙江等地，其中黑龙江省牡丹江地区海林市、东宁市（2012年12月晋升为国家级木耳批发市场）和吉林省蛟河县黄松甸镇是中国最大的黑木耳基地。国内有9个种，黑龙江拥有现有的全部8个品种，云南现有7个种、河南卢氏县有一种。野生黑木耳主要分布在大小兴安岭林区、秦巴山脉、伏牛山脉、辽宁桓仁等。湖北房县、随州、四川青川、云南文山、红河、保山、德宏、丽江、大理、西双版纳、曲靖等地州市和河南省卢氏县是中国木耳的生产区。
